Сколько родов существует у коронавирусов?
Стандартный ответ — «четыре: альфа, бета, гамма и дельта». Он повторяется в сотнях материалов и в большинстве конспектов, и он неполный. Четыре рода — это содержимое одного подсемейства, а в семействе Coronaviridae их три. Всего в семействе шесть родов, 28 подродов и 54 вида.
Разница не академическая. От того, к какому роду и виду отнесён возбудитель, зависит вполне практическая вещь — группа патогенности по приложению 1 к СанПиН 3.3686-21, а значит, требования к лаборатории, которая с ним работает. Разбираем структуру семейства, новые бинарные названия видов, которые ICTV ввёл в 2023–2024 годах, и российскую нормативную рамку вокруг коронавирусных инфекций.
Короткий ответ и почему «четыре» — неполный
Если вопрос звучит «сколько родов у коронавирусов», корректных ответов два, и оба нужно уметь произнести.
Шесть — в семействе
Семейство Coronaviridae по действующей таксономии Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) включает шесть родов, распределённых по трём подсемействам, а также 28 подродов и 54 вида.
Четыре — в подсемействе
Привычные Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus и Deltacoronavirus — это роды подсемейства Orthocoronavirinae, то есть «собственно коронавирусов». Именно они инфицируют млекопитающих и птиц, и именно о них идёт речь в клиническом контексте.
Откуда берётся ошибка. Подсемейства Letovirinae и Pitovirinae были выделены позже классической четвёрки и клинического значения для человека не имеют: их хозяева — амфибии и костные рыбы. Поэтому в обзорных текстах о них просто не вспоминают, а фразу «четыре рода подсемейства Orthocoronavirinae» сокращают до «четыре рода коронавирусов». На экзамене или в методичке это превращается в прямую фактическую ошибку — семейство и подсемейство не одно и то же.
Как устроено семейство Coronaviridae
Полная таксономическая цепочка выглядит так: порядок Nidovirales → подпорядок Cornidovirineae → семейство Coronaviridae → подсемейство → род → подрод → вид.
| Подсемейство | Роды | Хозяева |
|---|---|---|
| Orthocoronavirinae | Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, Deltacoronavirus | Млекопитающие и птицы |
| Letovirinae | Alphaletovirus | Амфибии (лягушки) |
| Pitovirinae | Alphapironavirus | Костные рыбы (лосось) |
Геном коронавирусов — одноцепочечная РНК положительной полярности размером 22–36 тысяч нуклеотидов в пределах всего семейства и 26–31 тысячи у ортокоронавирусов. Это один из самых крупных геномов среди РНК-содержащих вирусов: для сравнения, у вируса гриппа A он примерно в два с лишним раза меньше. Название семейства связано с морфологией вириона — шиповидные гликопротеиновые выступы S-белка на электронной микрофотографии формируют образ солнечной короны.
Деление на роды — не историческое, а филогенетическое. До пересмотра классификации коронавирусы делили на три группы, обозначавшиеся цифрами, и это деление опиралось в основном на серологию. Современное родовое деление построено на анализе консервативных участков генома, прежде всего гена РНК-зависимой РНК-полимеразы. Поэтому «группа 1» из старых учебников и род Alphacoronavirus — пересекающиеся, но не тождественные понятия, и переносить выводы из одной системы в другую напрямую нельзя.
Четыре рода ортокоронавирусов
Клинически значимая часть семейства — подсемейство Orthocoronavirinae. Альфа- и бетакоронавирусы инфицируют млекопитающих, прежде всего рукокрылых; гамма- и дельтакоронавирусы — преимущественно птиц, но встречаются и у млекопитающих.
| Род | Круг хозяев | Значимые для человека представители |
|---|---|---|
| Alphacoronavirus | Млекопитающие, прежде всего летучие мыши | HCoV-229E и HCoV-NL63 — возбудители сезонных ОРВИ. Ветеринарно значимы вирус трансмиссивного гастроэнтерита свиней, вирус эпидемической диареи свиней, коронавирус кошек |
| Betacoronavirus | Млекопитающие, прежде всего летучие мыши и грызуны | Все три эмерджентные инфекции человека: SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2. Плюс сезонные HCoV-OC43 и HCoV-HKU1 |
| Gammacoronavirus | Преимущественно птицы, отдельные виды — у морских млекопитающих | Прямого значения для человека нет. Типовой представитель — вирус инфекционного бронхита кур |
| Deltacoronavirus | Птицы и некоторые млекопитающие | Прямого значения для человека нет. Известен дельтакоронавирус свиней |
Внутри рода Betacoronavirus выделяют пять подродов: Embecovirus, Hibecovirus, Merbecovirus, Nobecovirus и Sarbecovirus. Подродовое деление — не формальность: именно оно объясняет, почему SARS-CoV и SARS-CoV-2 оказались в одном таксоне (подрод Sarbecovirus), а MERS-CoV — в другом (Merbecovirus). Сезонные HCoV-OC43 и HCoV-HKU1 относятся к подроду Embecovirus, представители которого несут дополнительный ген гемагглютинин-эстеразы между ORF1 и геном S-белка.
Устаревшая деталь, которая до сих пор кочует по конспектам. Подроды бетакоронавирусов раньше обозначались линиями A, B, C и D. Сейчас у них есть собственные названия, и запись «линия B» вместо Sarbecovirus — такой же архаизм, как «группа 1» вместо Alphacoronavirus.
Новые названия видов: Betacoronavirus pandemicum и другие
Самое заметное изменение последних лет касается не родов, а видов. ICTV перевёл названия видов вирусов на бинарную латинскую номенклатуру — по образцу биологической: род плюс видовой эпитет. Описательные английские названия вроде Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus заменены латинизированными.
| Вирус | Текущее название вида | Подрод |
|---|---|---|
| SARS-CoV и SARS-CoV-2 | Betacoronavirus pandemicum | Sarbecovirus |
| MERS-CoV | Betacoronavirus cameli | Merbecovirus |
| HCoV-OC43 | Betacoronavirus gravedinis | Embecovirus |
| HCoV-229E | Alphacoronavirus chicagoense | — |
| HCoV-NL63 | Alphacoronavirus amsterdamense | Setracovirus |
| Коронавирусы кошек, собак, вирус трансмиссивного гастроэнтерита свиней | Alphacoronavirus suis (ранее Alphacoronavirus 1) | — |
Не перепутайте вид и вирус. Betacoronavirus pandemicum — это название вида, а не возбудителя COVID-19. Сам вирус по-прежнему называется SARS-CoV-2, и именно это обозначение используется в диагностике, в протоколах и в нормативных документах. Вид объединяет и SARS-CoV, вызвавший вспышку 2003 года, и SARS-CoV-2 — они родственники внутри одного вида, но это разные вирусы. В учебном материале корректная формулировка звучит так: «SARS-CoV-2 — вирус вида Betacoronavirus pandemicum, подрод Sarbecovirus, род Betacoronavirus».
Группы патогенности: где таксономия становится режимом работы
Вот место, где ответ на вопрос о родах перестаёт быть теорией. Приложение 1 к СанПиН 3.3686-21 «Патогенные биологические агенты по группам патогенности» упоминает семейство Coronaviridae дважды — и в разных группах.
II группа патогенности
Перечислены поимённо: вирус SARS (возбудитель ТОРС), коронавирус MERS (ближневосточный респираторный синдром) и вирус SARS-CoV-2 (COVID-19). Все трое — бетакоронавирусы.
IV группа патогенности
Одной строкой: «коронавирусы человека» — как возбудители острых респираторных инфекций (профузного насморка без температуры) и энтеритов. Это как раз сезонные HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 и HCoV-HKU1.
Практический смысл прямой: работа с ПБА II группы и работа с ПБА IV группы — это разные требования к помещениям, оборудованию, допуску персонала и разрешительным документам лаборатории. Разница между «коронавирус» и «какой именно коронавирус» здесь стоит лицензии. Как организованы преаналитический этап и сам забор материала при коронавирусной инфекции, мы разбирали отдельно — в материале лабораторная диагностика новой коронавирусной инфекции.
Коронавирусы в других разделах тех же санитарных правил. В разделе о внебольничных пневмониях коронавирусы названы среди семи семейств респираторных вирусов, которые следует учитывать при этиологической расшифровке, — наряду с ортомиксовирусами, парамиксовирусами, пикорнавирусами, аденовирусами, парвовирусами и хантавирусами. Там же сказано, что при заболеваниях, вызванных высокопатогенными вирусами гриппа и некоторыми коронавирусами, источником могут быть птицы и различные теплокровные животные. А в разделе об инфекциях, связанных с оказанием медицинской помощи, SARS-CoV и MERS-CoV прямо перечислены среди возбудителей ИСМП.
Российская нормативная рамка
Здесь есть два документа, вокруг которых чаще всего возникает путаница.
Перечень опасных для окружающих заболеваний — действует
Постановление Правительства РФ от 01.12.2004 № 715 утверждает перечень социально значимых заболеваний и перечень заболеваний, представляющих опасность для окружающих. Постановлением Правительства РФ от 31.01.2020 № 66 перечень дополнен пунктом 16 — «коронавирусная инфекция (2019-nCoV)». Обратите внимание на название: в действующей редакции перечня сохраняется временное обозначение вируса, присвоенное в самом начале вспышки, — уже после того, как ICTV дал вирусу имя SARS-CoV-2, а ВОЗ назвала болезнь COVID-19.
СП 3.1.3597-20 — не действуют
Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.3597-20 «Профилактика новой коронавирусной инфекции (COVID-19)», утверждённые постановлением Главного государственного санитарного врача РФ от 22.05.2020 № 15, утратили силу с 1 января 2024 года в связи с истечением срока действия. Ссылки на них в стандартных операционных процедурах, планах противоэпидемических мероприятий и учебных материалах требуют замены — сегодня применяется СанПиН 3.3686-21.
Коды МКБ-10
Для COVID-19 ВОЗ ввела экстренные коды: U07.1 — COVID-19, вирус идентифицирован (подтверждён лабораторно), и U07.2 — COVID-19, вирус не идентифицирован (диагноз установлен клинически или эпидемиологически без лабораторного подтверждения). Для остальных коронавирусных инфекций сохраняется код B34.2 «Коронавирусная инфекция неуточнённой локализации» — но из него исключены U07.1 и U07.2, то есть для COVID-19 он не применяется.
Где искать тактику
С 2020 года лечение регулировалось временными методическими рекомендациями Минздрава России «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)»; последняя в этой серии — версия 19 от 27.05.2025. Сейчас тактику ведения взрослых пациентов определяют клинические рекомендации по коронавирусной инфекции, размещённые в рубрикаторе клинических рекомендаций Минздрава России, — именно там и нужно сверять актуальную версию перед подготовкой локальных алгоритмов.
Обучение для специалистов
Уточните программу по направлению «Вирусология» с учётом вашей подготовки.
Вирусология
Клиническая лабораторная диагностика
Частые вопросы
Так сколько всё-таки родов у коронавирусов — четыре или шесть?
Шесть — в семействе Coronaviridae. Четыре — в подсемействе Orthocoronavirinae: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, Deltacoronavirus. Остальные два рода — Alphaletovirus (подсемейство Letovirinae, хозяева — амфибии) и Alphapironavirus (подсемейство Pitovirinae, хозяева — костные рыбы). Всего в семействе 6 родов, 28 подродов и 54 вида.
Какие коронавирусы вызывают заболевания у человека?
Семь известных вирусов из двух родов. Альфакоронавирусы: HCoV-229E и HCoV-NL63 — сезонные ОРВИ. Бетакоронавирусы: сезонные HCoV-OC43 и HCoV-HKU1, а также три эмерджентных возбудителя — SARS-CoV (ТОРС, 2003), MERS-CoV (ближневосточный респираторный синдром, 2012) и SARS-CoV-2 (COVID-19). Все три тяжёлые инфекции вызваны представителями одного рода — Betacoronavirus, что и определяет приоритеты вирусологического надзора.
К какой группе патогенности относится SARS-CoV-2?
Ко II группе. В приложении 1 к СанПиН 3.3686-21 в разделе Coronaviridae II группы патогенности перечислены вирус SARS, коронавирус MERS и вирус SARS-CoV-2. Сезонные коронавирусы человека отнесены к IV группе — как возбудители острых респираторных инфекций и энтеритов. Это разные режимы работы лаборатории, поэтому указывать в документах просто «коронавирус» недостаточно.
Что такое Betacoronavirus pandemicum?
Это официальное название вида, к которому относятся и SARS-CoV, и SARS-CoV-2. Раньше вид назывался Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus; ICTV перевёл названия видов вирусов на бинарную латинскую номенклатуру. Название самого вируса не изменилось — он по-прежнему SARS-CoV-2. Аналогично MERS-CoV относится к виду Betacoronavirus cameli, HCoV-229E — к виду Alphacoronavirus chicagoense, HCoV-NL63 — к Alphacoronavirus amsterdamense.
Действуют ли СП 3.1.3597-20 по COVID-19?
Нет. Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.3597-20 «Профилактика новой коронавирусной инфекции (COVID-19)», утверждённые постановлением Главного государственного санитарного врача РФ от 22.05.2020 № 15, утратили силу с 1 января 2024 года в связи с истечением срока действия. Профилактика инфекционных болезней регулируется СанПиН 3.3686-21. При этом коронавирусная инфекция остаётся в перечне заболеваний, представляющих опасность для окружающих, — пункт 16 перечня, утверждённого постановлением Правительства РФ от 01.12.2004 № 715.
Почему гамма- и дельтакоронавирусы важны, если человека они не поражают?
Потому что они очерчивают второй эволюционный резервуар. Альфа- и бетакоронавирусы связаны прежде всего с рукокрылыми, гамма- и дельтакоронавирусы — с птицами, при этом отдельные их представители обнаружены у млекопитающих. Ключевая биологическая особенность коронавирусов — высокая частота рекомбинации при коинфекции одной клетки, и именно она делает межвидовые переходы возможными. Поэтому надзор ведётся и за теми родами, которые сегодня человека не затрагивают.
Как корректно записать таксономию SARS-CoV-2 в учебном материале?
Полная цепочка: порядок Nidovirales → подпорядок Cornidovirineae → семейство Coronaviridae → подсемейство Orthocoronavirinae → род Betacoronavirus → подрод Sarbecovirus → вид Betacoronavirus pandemicum → вирус SARS-CoV-2. Названия таксонов пишутся курсивом и с прописной буквы, название вируса — обычным шрифтом.
- International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), отчёт по семейству Coronaviridae: состав подсемейств и родов, количество таксонов (6 родов, 28 подродов, 54 вида), положение в порядке Nidovirales и подпорядке Cornidovirineae, размеры генома и круг хозяев каждого подсемейства.
- ICTV Virus Taxonomy Profile: Coronaviridae 2023 (Journal of General Virology) — выделение подсемейств Letovirinae и Pitovirinae, подроды рода Betacoronavirus.
- Бинарные названия видов ICTV: Betacoronavirus pandemicum (SARS-CoV, SARS-CoV-2), Betacoronavirus cameli (MERS-CoV), Betacoronavirus gravedinis (HCoV-OC43), Alphacoronavirus chicagoense (HCoV-229E), Alphacoronavirus amsterdamense (HCoV-NL63), Alphacoronavirus suis (ранее Alphacoronavirus 1).
- СанПиН 3.3686-21 «Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней», утверждены постановлением Главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 28.01.2021 № 4 — приложение 1 «ПБА по группам патогенности» (раздел «Вирусы», Coronaviridae во II и IV группах), а также разделы о внебольничных пневмониях и об инфекциях, связанных с оказанием медицинской помощи.
- Постановление Правительства Российской Федерации от 01.12.2004 № 715 «Об утверждении перечня социально значимых заболеваний и перечня заболеваний, представляющих опасность для окружающих» — пункт 16 перечня в редакции постановления Правительства Российской Федерации от 31.01.2020 № 66.
- Постановление Главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 22.05.2020 № 15 «Об утверждении санитарно-эпидемиологических правил СП 3.1.3597-20 „Профилактика новой коронавирусной инфекции (COVID-19)“» — утратило силу с 01.01.2024 в связи с истечением срока действия.
- Временные методические рекомендации Минздрава России «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)», версия 19 от 27.05.2025; рубрикатор клинических рекомендаций Минздрава России.
