Тест НМО с ответами по теме «Молекулярно-генетические методы в бактериологии и вирусологии» Интерактивный образовательный модуль (ИОМ)

1. В каком из перечисленных методов участвует белок, связывающий одноцепочечную ДНК (SSB)?

1. транскрипционная амплификация
2. рекомбиназно-полимеразная амплификация
3. мультилокусное сиквенс-типирование
4. секвенирование по Сэнгеру
5. полимеразная цепная реакция.

2. В основе секвенирования по Сэнгеру лежит

1. внесение ошибок при синтезе ДНК в случае резкого избытке одного из дезоксирибонуклеозидтрифосфатов
2. изменение pH при элонгации молекулы ДНК
3. высвобождение пирофосфата при элонгации молекулы ДНК
4. остановка синтеза молекулы ДНК при включении дидезоксирибонуклеозидтрифосфата
5. химическое расщепление ДНК по определенным азоотистым основаниям.

3. Дидезоксирибонуклеозидтрифосфаты, используемые при секвенировании по Сэнгеру, характеризуются

1. наличием в составе аминокислот
2. отсутствием всех гидроксильных групп
3. ациклической структурой вместо остатка дезоксирибозы
4. отсутствием азотистого основания
5. отсутствием 3'-OH группы.

4. Для проведения метагеномного исследования секвенированию должна быть подвергнута

1. тотальная ДНК микробного сообщества
2. мРНК чистой культуры прокариот
3. геномная ДНК эукариотического организма
4. рРНК чистой культуры прокариот
5. геномная ДНК чистой культуры прокариот.

5. Из какого микроорганизма выделена ДНК-полимераза, наиболее часто используемая для проведения ПЦР?

1. облигатный анаэроб Clostridium difficile
2. экстремальный термофил Thermus aquaticus
3. психрофил Yersinia pestis
4. облигатный аэроб Pseudomonas aeruginosa
5. алкалифил Vibrio cholerae.

6. Какая из перечисленных технологий лежит в основе метагеномных исследований?

1. полимеразная цепная реакция в реальном времени
2. гель-электрофорез
3. секвенирование по Сэнгеру
4. Next generation sequencing (NGS).

7. Какие из перечисленных методов относятся к методам амплификации нуклеиновых кислот?

1. рекомбиназно-полимеразная амплификация
2. мультилокусное сиквенс-типирование
3. полимеразная цепная реакция
4. транскрипционная амплификация
5. секвенирование по Сэнгеру.

8. Какие компоненты обязательно должны присутствовать в реакционной смеси для ПЦР?

1. агароза
2. ДНК-полимераза
3. нуклеозидтрифосфаты
4. праймеры
5. РНК-полимераза.

9. Какие методы могут быть использованы для наработки большого количества копий участка ДНК, пригодных для секвенирования по Сэнгеру?

1. молекулярное клонирование
2. денатурация ДНК
3. элонгация ДНК
4. полимеразная цепная реакция.

10. Какие шаги обычно входят в один цикл ПЦР?

1. элонгация
2. отжиг праймеров
3. транскрипция
4. денатурация
5. трансляция.

11. Какое количество флуоресцентных меток используется в одной реакции автоматизированного секвенирования по Сэнгеру?

1. одна (на один праймер)
2. две (по одной на каждую цепь двойной спирали)
3. шестьдесят четыре (по одной на каждый кодон)
4. двадцать (по одной на каждую из аминокислот)
5. четыре (по одной на каждый тип азотистого основания).

12. Какой из перечисленных ферментов участвует в транскрипционной амплификации?

1. ДНК-гираза
2. щелочная фосфатаза
3. обратная транскриптаза
4. ДНК-лигаза.

13. Какой из шагов ПЦР происходит при наибольшей температуре?

1. все шаги происходят при одинаковой температуре
2. элонгация
3. отжиг праймеров
4. денатурация.

14. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР?

1. производить электропорацию бактериальных клеток
2. ионизировать молекулы нуклеиновых кислот
3. производить детекцию бактериальных и вирусных белков
4. заменять реакционный буфер после каждого цикла
5. изменять температуру реакционной смеси по заданной программе.

15. Какой фермент играет основную роль в ПЦР?

1. эндонуклеаза рестрикции
2. ДНК-лигаза
3. сайт-специфическая рекомбиназа
4. ДНК-метилтрансфераза
5. термостабильная ДНК-полимераза.

16. Какую реакцию способна катализировать РНКаза H?

1. синтеза РНК на матрице белка
2. синтеза случайных последовательностей ДНК
3. разрушение РНК находящейся в двойной спирали с ДНК
4. синтеза белка на матрице РНК
5. синтеза РНК на матрице ДНК.

17. Какую реакцию способна катализировать обратная транскриптаза?

1. синтеза белка на матрице РНК
2. синтеза РНК на матрице белка
3. синтеза случайных последовательностей ДНК
4. синтеза ДНК на матрице РНК
5. синтеза РНК на матрице ДНК.

18. МЛСТ является методом

1. внутривидового типирования бактерий
2. определения чувствительности к антибиотикам
3. исследования состава микробных сообществ
4. амплификации ДНК.

19. Наиболее точным методом видовой идентификации чистой культуры бактерий является

1. ПЦР в реальном времени гена ДНК-гиразы
2. определение массы бактериальной хромосомы
3. гель-электрофорез ДНК-полимеразы
4. определение числа копий гена 16S рРНК в хромосоме
5. секвенирование гена 16S рРНК.

20. Непрерывные последовательности ДНК, собираемые из отдельных прочтений по перекрывающимся участкам, носят название

1. таксоны
2. контиги
3. спектры
4. метагеномы.

21. Отличия реакционной смеси для реакции секвенирования по Сэнгеру от реакционной смеси для ПЦР состоят в

1. отсутствии ферментов
2. присутсвии РНК-полимеразы
3. наличии только одного праймера
4. наличии меченых дидезоксинуклеозидтрифосфатов
5. присутствии антибиотиков.

22. Праймеры, применяемые в ПЦР — это

1. короткие одноцепочечные молекулы ДНК
2. радиоактивные или биотиновые метки
3. длинные двухцепочечные молекулы ДНК
4. термостабильные ферменты
5. нуклеозидтрифосфаты.

23. При каком из перечисленных методов осуществляется секвенирование множества последовательностей фрагмента гена 16S рРНК?

1. метаболомика
2. метапротеомика
3. метаинтерактомика
4. метатаксономика.

24. При проведении ПЦР достройка каждой цепи ДНК до исходного двухцепочечного состояния с помощью термостабильной ДНК-полимеразы преимущественно происходит на стадии

1. гель-электрофореза
2. элонгации
3. отжига праймеров
4. денатурации
5. выделения ДНК.

25. С какой целью применяются интеркалирующие красители в ПЦР?

1. они образуют флуоресцентные комплексы с молекулами ДНК
2. они обеспечивают разную подвижность двойных спиралей ДНК в зависимости от размера
3. они придают отрицательный заряд молекулам ДНК
4. они разрушают молекулы ДНК
5. они способствуют денатурации двойных спиралей ДНК.

26. Секвенирование ДНК представляет собой

1. определение молекулярной массы молекулы ДНК
2. многократное копирование определенного участка ДНК
3. определение вторичной структуры молекулы ДНК
4. прочтение нуклеотидной последовательности
5. анализ повреждений молекулы ДНК.

27. Технологии NGS используют для того, чтобы провести

1. секвенирование одного длинного фрагмента ДНК
2. очистку ДНК от посторонних примесей
3. параллельное секвенирование множества фрагментов ДНК
4. определение спектра масс белков в бактериальной клетке
5. параллельное культивирование множества бактериальных штаммов.

28. Что должно происходить в идеальном случае за один цикл ПЦР?

1. присоединение одного или нескольких нуклеотидов
2. разрушение половины молекул ДНК-полимеразы
3. объединение нескольких олигонуклеотидов в одну цепь
4. высвобождение большого количества квантов света
5. удвоение концентрации продукта реакции.

29. Чтобы осуществлять выявление молекул РНК с помощью ПЦР, необходимо сначала синтезировать на их матрице ДНК. Какой фермент способен осуществлять такую реакцию?

1. ДНК-полимераза
2. обратная транскриптаза
3. ДНК-лигаза
4. РНК-полимераза
5. транспозаза.