Тест НМО с ответами по теме «Методы амплификации нуклеиновых кислот в диагностике инфекционных заболеваний» Интерактивный образовательный модуль (ИОМ)

1. В каком из перечисленных методов используется РНК-полимераза?

1. в транскрипционной амплификации
2. в мультиплексной ПЦР
3. в ПЦР в реальном времени
4. в гель-электрофорезе
5. в выделении ДНК.

2. В процессе ПЦР синтез праймеров

1. осуществляется ДНК-полимеразой
2. не осуществляется праймеры добавляются до начала реакции
3. осуществляется ферментом праймазой
4. не осуществляется праймеры необходимы только для репликации ДНК in vivo
5. осуществляется совместным действием ДНК-полимеразы и праймазы.

3. В реакционной смеси для ПЦР находится 100 копий амплифицируемых участков ДНК. Какое количество копий будет в реакционной смеси через 3 цикла в случае идеальной ПЦР?

1. 70
2. 800
3. 100
4. 500
5. 1000.

4. В чем будет состоять основное отличие системы для ПЦР-диагностики Mycoplasma genitalium от системы для ПЦР-диагностики Trichomonas vaginalis?

1. в используемых красителях
2. в последовательностях праймеров
3. в структуре нуклеозидтрифосфатов
4. в используемых ферментах
5. в наборе питательных сред.

5. Дана последовательность ДНК 5'-CGCAT-3'. Какая из указанных последовательностей будет комплементарной к ней?

1. 5'-ATGCG-3'
2. 5'-AAATT-3'
3. 5'-TAGCT-3'
4. 5'-CAGAT-3'
5. 5'-CGCAT-3'.

6. Для каких молекул, используемых в методах амплификации нуклеиновых кислот, характерно наличие внутреннего самокомплементарного участка?

1. линейные разрушаемые зонды
2. праймеры
3. молекулярные "маячки"
4. интеркалирующие красители.

7. Какие азотистые основания обычно входят в состав ДНК микроорганизмов?

1. гуанин (G)
2. урацил (U)
3. тимин (T)
4. аденин (A)
5. цитозин (C).

8. Какие компоненты обязательно должны присутствовать в реакционной смеси для ПЦР?

1. агароза
2. праймеры
3. ДНК-полимераза
4. нуклеозидтрифосфаты
5. РНК-полимераза.

9. Какие пары комплементарных азотистых оснований обычно присутствуют в ДНК микроорганизмов?

1. G-C
2. G-U
3. A-T
4. A-U
5. G-G.

10. Какие присоединенные группы содержат в своей структуре линейные разрушаемые зонды?

1. фосфорная кислота
2. полиэтиленгликоль
3. флуорофор
4. дезоксирибоза
5. гаситель.

11. Какие шаги обычно входят в один цикл ПЦР?

1. трансляция
2. элонгация
3. отжиг праймеров
4. денатурация
5. транскрипция.

12. Каково назначение гасителей, входящих в состав молекулярных зондов?

1. они предотвращают присоединение зонда к ДНК
2. они служат затравкой для синтеза ДНК
3. они предотвращают флуоресценцию флуорофора
4. они ингибируют активность ДНК-полимеразы
5. они запускают разрушение зонда.

13. Какой из перечисленных фрагментов ДНК будет двигаться с наибольшей скоростью при гель-электрофорезе?

1. 500 пар нуклеотидов
2. 300 пар нуклеотидов
3. 100 пар нуклеотидов
4. 200 пар нуклеотидов
5. 1000 пар нуклеотидов.

14. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР в реальном времени?

1. измерять электропроводность реакционной смеси
2. измерять флуоресценцию реакционной смеси
3. фрагментировать ДНК ультразвуком
4. проводить лазерную десорбцию ДНК
5. проводить капиллярный электрофорез.

15. Какой способностью должен обладать амплификатор для проведения ПЦР?

1. изменять температуру реакционной смеси по заданной программе
2. ионизировать молекулы нуклеиновых кислот
3. производить детекцию бактериальных и вирусных белков
4. производить электропорацию бактериальных клеток
5. заменять реакционный буфер после каждого цикла.

16. Какую длину последовательности ДНК можно прочитать с помощью ПЦР?

1. 100 пар нуклеотидов
2. 10 пар нуклеотидов
3. ПЦР не является методом прочтения молекул ДНК а только методом их амплификации
4. 1000 пар нуклеотидов
5. длина прочтенной последовательности будет определяться количеством циклов ПЦР.

17. Какую из перечисленных реакций можно проводить при постоянной температуре?

1. конвенциональная ПЦР
2. ПЦР в реальном времени
3. транскрипционная амплификация
4. мультиплексная ПЦР
5. ПЦР с обратной транскрипцией.

18. Какую реакцию способна катализировать обратная транскриптаза?

1. синтеза ДНК на матрице РНК
2. синтеза РНК на матрице ДНК
3. синтеза случайных последовательностей ДНК
4. синтеза РНК на матрице белка
5. синтеза белка на матрице РНК.

19. Наличие каких остатков придает молекулам ДНК отрицательный заряд в водных растворах?

1. аспарагиновой кислоты
2. фосфорной кислоты
3. глутаминовой кислоты
4. соляной кислоты
5. дезоксирибозы.

20. Наличие какой ферментативной активности ДНК-полимеразы, необходимо для использования линейно разрушаемых зондов?

1. хеликазной
2. ДНК-лигазной
3. РНК-полимеразной
4. протеазной
5. 5’-3’-экзонуклеазной.

21. Олигонуклеотиды, необходимые для ПЦР, которые комплементарны участкам ДНК из противоположных цепей, находящимся на концах последовательности-мишени, называются

1. праймерами
2. векторами
3. промоторами
4. молекулярными зондами
5. маркерами.

22. Основным требованием, которое предъявляется к используемым в ПЦР ДНК-полимеразам, является

1. буферные свойства
2. кислотоустойчивость
3. эндонуклеазная активность
4. термостабильность.

23. После проведенного курса антибиотикотерапии урогенитального хламидиоза через три дня был взят анализ на выявление Chlamydia trachomatis с помощью ПЦР. Результат анализа оказался положительным. Свидетельствует ли это о неэффективности терапии?

1. да так как это означает наличие живого возбудителя
2. нет так как антимикробные препараты в биологическом материале могут приводить к ложноположительным результатам
3. нет так как ДНК способна длительно сохраняться после элиминации возбудителя
4. нет так как ПЦР не может быть использован для выявления хламидий
5. нет так как ПЦР не может быть использован для выявления возбудителей инфекций передающихся половым путём.

24. Праймеры, применяемые в ПЦР – это

1. нуклеозидтрифосфаты
2. короткие одноцепочечные молекулы ДНК
3. радиоактивные или биотиновые метки
4. термостабильные ферменты
5. длинные двухцепочечные молекулы ДНК.

25. Преимуществами методов амплификации нуклеиновых кислот в реальном времени по сравнению с использованием электрофоретической детекции, являются

1. исключение риска контаминации последующих образцов продуктами амплификации
2. возможность определения количества специфического участка нуклеиновой кислоты в образце
3. возможность обнаружения возбудителей вирусных инфекционных заболеваний
4. возможность выявления не только тех возбудителей которые изначально предполагались
5. уменьшение времени до получения результата.

26. С какой целью при гель-электрофорезе применяется бромистый этидий?

1. он обеспечивает разную подвижность двойных спиралей ДНК в зависимости от размера
2. он образует флуоресцентные комплексы с молекулами ДНК
3. от придает отрицательный заряд молекулам ДНК
4. он формирует структуру геля
5. он способствует денатурации двойных спиралей ДНК.

27. С помощью какого из перечисленных методов, возможно определить длину молекул ДНК, полученных в результате ПЦР?

1. транскрипционная амплификация
2. обратная транскрипция
3. диско-диффузионный метод
4. электропорация
5. гель-электрофорез.

28. С помощью чего в полимеразной цепной реакции происходит разделение цепей ДНК?

1. топоизомеразы
2. бромистого этидия
3. РНКазы H
4. РНК-полимеразы
5. температуры.

29. Сорбция молекул ДНК на колонке из диоксида кремния может использоваться в процессе

1. гель-электрофореза
2. отжига праймеров
3. выделения ДНК
4. элонгации
5. денатурации.

30. Чем будет определяться длина продуктов ПЦР?

1. концентрациями нуклеозидтрифосфатов
2. расстоянием между местами отжига праймеров в исходной ДНК
3. концентрацией исходных молекул ДНК
4. температурой при которой происходит денатурация
5. количеством циклов ПЦР.

31. Чем полимеразы для ПЦР с «горячим» стартом отличаются от классических?

1. они могут использовать в качестве праймера пептид Vpg
2. они имеют «вытесняющую» активность что позволяет обходиться без стадии денатурации
3. их ферментативная активность заблокирована при низких температурах для предотвращения образования неспецифичных продуктов
4. они со схожей эффективностью присоединяют дезокси- и дидезокси-нуклеозидтрифосфаты.

32. Что должно присутствовать в реакционной смеси для постановки мультиплексной ПЦР в реальном времени?

1. гуанидина тиоцианат и диоксид кремния
2. несколько зондов способных связываться с получающимися продуктами реакции и содержащих разные флуорофоры
3. несколько различных интеркалирующих красителей
4. смесь различных РНКаз.

33. Что должно происходить в идеальном случае за один цикл ПЦР?

1. разрушение половины молекул ДНК-полимеразы
2. высвобождение большого количества квантов света
3. удвоение концентрации продукта реакции
4. присоединение одного или нескольких нуклеотидов
5. объединение нескольких олигонуклеотидов в одну цепь.

34. Что происходит в ПЦР на стадии денатурации?

1. присоединение праймера к комплементарному участку ДНК
2. достройка комплементарной цепи ДНК с помощью ДНК-полимеразы
3. разрушение ДНК-полимеразы
4. разделение цепей ДНК под действием температуры
5. разделение двухцепочечных молекул ДНК по массе.

35. Что является основным отличием ПЦР в реальном времени от конвенциональной ПЦР?

1. добавление новой порции ДНК-полимеразы после каждого цикла
2. использование РНК-полимеразы
3. определение концентрации продукта ПЦР непосредственно в ходе реакции
4. использование праймеров комплементарных концам целевого продукта реакции
5. отсутствие стадии денатурции.