Тест НМО с ответами по теме «Современные методы исследования микробиоты толстого кишечника человека» Интерактивный образовательный модуль (ИОМ)

1. Большинство представителей микробиоты толстого кишечника взрослого человека являются

1. облигатными аэробами
2. аэротолерантными бактериями
3. факультативными анаэробами
4. облигатными анаэробами.

2. В синтезе каких веществ, имеющих биологическую активность в организме человека, принимают участие бактерии нормальной микробиоты?

1. липополисахарид
2. вторичные желчные кислоты
3. короткоцепочечные жирные кислоты
4. первичные желчные кислоты.

3. Выберите верные утверждения

1. большую часть микробиоты толстого кишечника взрослого человека составляют бифидобактерии и лактобациллы
2. набор видов бактерий обнаруживаемых в микробиоте толстого кишечника отличается у разных людей
3. состав микробиоты человека в большей степени объясняется факторами окружающей среды и совместным проживанием чем наследственностью
4. большую часть микробиоты толстого кишечника взрослого человека составляют эшерихии
5. на состав микробиоты влияют множество факторов: заболевания особенности диеты прием лекарств.

4. Для микробиоты толстого кишечника грудных детей характерна высокая численность представителей рода

1. Treponema
2. Mycobacterium
3. Bifidobacterium
4. Yersinia
5. Bordetella.

5. Для проведения метагеномного исследования секвенированию должна быть подвергнута

1. геномная ДНК эукариотического организма
2. мРНК чистой культуры прокариот
3. геномная ДНК чистой культуры прокариот
4. тотальная ДНК микробного сообщества
5. рРНК чистой культуры прокариот.

6. Достоинствами культивирования как метода исследования микробиоты человека являются

1. возможность получить представления о полном разнообразии доминирующих групп микроорганизмов
2. возможность оценить генетическое разнообразие представителей микробиоты
3. возможность определять абсолютные численности микроорганизмов
4. возможность получать чистые культуры микроорганизмов.

7. Достоинствами метагеномики как метода исследования микробиоты человека являются

1. возможность оценить генетическое разнообразие представителей микробиоты
2. возможность получить представления о полном разнообразии доминирующих групп микроорганизмов
3. низкая стоимость и трудоемкость
4. возможность получать чистые культуры микроорганизмов.

8. Какая из перечисленных технологий лежит в основе метагеномных исследований?

1. высокопроизводительное секвенирование ДНК
2. электропорация
3. масс-спектрометрия
4. гель-электрофорез
5. полимеразная цепная реакция в реальном времени.

9. Какие из перечисленных веществ входят в понятие "короткоцепочечные жирные кислоты"?

1. пропионат
2. таурохолат
3. ацетат
4. дезоксихолат
5. бутират.

10. Какие этапы обязательно включают в себя метагеномные исследования?

1. выделение чистых культур бактерий
2. выделение ДНК из биологического образца
3. массовое параллельное секвенирование молекул ДНК
4. MALDI-ToF масс-спектрометрия.

11. Какое из перечисленных веществ, способных производиться бактериями кишечной микробиоты, обладает канцерогенными свойствами за счёт способности алкилировать ДНК?

1. ацетат
2. колибактин
3. пептидогликан
4. липополисахарид.

12. Какой из перечисленных методов видовой идентификации бактерий является наиболее быстрым?

1. MALDI-ToF масс-спектрометрия
2. секвенирование фрагмента гена 16S рРНК
3. биохимическая идентификация по спектру ферментативной активности
4. секвенирование и анализ полного генома.

13. Какой этап включают в себя исследования, проводимые в рамках подхода метатаксономики?

1. амплификация фрагмента гена 16S рРНК
2. электропорация
3. выделение чистых культур
4. биохимическая идентификация чистых культур
5. масс-спектрометрия.

14. Колонизация кишечника какими бактериями может являться причиной антибиотик-ассоциированной диареи?

1. Bacteroides ovatus
2. Clostridium scindens
3. Barnesiella intestinihominis
4. Clostridium difficile
5. Faecalibacterium prausnitzii.

15. Контиги представляют собой

1. гены наиболее консервативные среди бактерий
2. непрерывные участки геномов получаемые за счёт сборки отдельных прочтений
3. спектры масс бактериальных белков
4. полные бактериальные геномы.

16. Метагеномные исследования позволяют исследовать

1. изменение функционирования бактериальной клетки при смене условий
2. состав микробной популяции в биологическом образце
3. набор метаболитов в составе бактериальной клетки
4. реакцию клеток человека на активность микробиоты.

17. Микроанаэростаты представляют собой

1. герметичные сосуды в которых можно создать бескислородную среду для культивирования бактерий
2. приборы для стерилизации питательных сред
3. системы для биохимической идентификации бактерий
4. системы для выделения бактериальной ДНК.

18. Наиболее точным методом видовой идентификации чистой культуры бактерий является

1. гель-электрофорез ДНК-полимеразы
2. секвенирование гена 16S рРНК
3. определение массы бактериальной хромосомы
4. ПЦР в реальном времени гена ДНК-гиразы
5. определение числа копий гена 16S рРНК в хромосоме.

19. Непрерывные последовательности ДНК, собираемые из отдельных прочтений по перекрывающимся участкам, носят название

1. энтеротипы
2. контиги
3. чистые культуры
4. спектры
5. таксоны.

20. Представители каких из перечисленных родов бактерий в часто встречаются в микробиоте толстого кишечника человека?

1. Yersinia
2. Faecalibacterium
3. Blautia
4. Neisseria
5. Chlamydia.

21. Представители каких из перечисленных родов бактерий в часто встречаются в микробиоте толстого кишечника человека?

1. Mycobacterium
2. Bacteroides
3. Alistipes
4. Borrelia
5. Salmonella.

22. Представители каких из перечисленных типов бактерий доминируют в микробиоте толстого кишечника взрослого человека?

1. Thermotogae
2. Calditrichaeota
3. Planctomycetes
4. Bacteroidetes
5. Firmicutes.

23. Представители каких из перечисленных типов бактерий представлены в микробиоте толстого кишечника взрослого человека единичными процентами?

1. Сyanobacteria
2. Chlamydiae
3. Actinobacteria
4. Aquificae
5. Proteobacteria.

24. При каком из перечисленных методов осуществляется секвенирование множества последовательностей фрагмента гена 16S рРНК?

1. метаболомика
2. метаинтерактомика
3. метатаксономика
4. метапротеомика.

25. С какой целью в основном применяется MALDI-ToF масс-спектрометрия в исследовании микробиоты толстого кишечника?

1. определение спектра масс нуклеиновых кислот выделенных из образца фекалий
2. получение чистых культур бактерий за счёт механического разобщения
3. определение спектра масс белков в образце фекалий
4. идентификация чистых культур бактерий по спектру масс белков
5. подсчёт численности бактерий определенного вида в биологическом образце.

26. Секвенирование ДНК представляет собой

1. определение молекулярной массы молекулы ДНК
2. прочтение нуклеотидной последовательности
3. многократное копирование определенного участка ДНК
4. анализ повреждений молекулы ДНК
5. определение вторичной структуры молекулы ДНК.

27. Соберите контиг из двух прочтений ДНК: ATCGTGAGTG и TGAGTGСССС

1. TTCGATTGCGAT
2. ATCGTGAGTGСССС
3. GCTGATGCAAACGA
4. CCCGATGCGATGCGAA.

28. Технологии NGS используют для того, чтобы провести

1. очистку ДНК от посторонних примесей
2. параллельное секвенирование множества фрагментов ДНК
3. определение спектра масс белков в бактериальной клетке
4. секвенирование одного длинного фрагмента ДНК
5. параллельное культивирование множества бактериальных штаммов.

29. Укажите механизмы колонизационной резистентности

1. продукция бактериоцинов
2. образование вторичных желчных кислот
3. конкуренция за питательные вещества
4. синтез пептидогликана.

30. Укажите молекулы, синтезируемые представителями микробиоты человека и распознаваемые паттерн-распознающими рецепторами человека (PRR)

1. пептид YY
2. первичные желчные кислоты
3. фрагменты пептидогликана
4. липополисахарид
5. уксусная кислота.

31. Часто встречающиеся варианты микробиоты, характеризующиеся преобладанием различных групп бактерий, называются

1. энтеротипы
2. метагеномы
3. бактериоцины
4. культуромы
5. дисбиозы.

32. Энетротипы представляют собой

1. часто встречающиеся варианты микробиоты толстого кишечника характеризующиеся преобладанием различных групп бактерий
2. внутривидовые группы бактерий характерные для микробиоты толстого кишечника
3. методы видовой идентификации микроорганизмов нормальной микробиоты толстого кишечника
4. типы бактерий к которым относятся численно доминирующие представители нормальной микробиоты толстого кишечника человека (т.е. Firmicutes Bacteroides).