Тест НМО с ответами по теме «Молекулярная эпидемиология инфекционных заболеваний (бактериология)» Интерактивный образовательный модуль (ИОМ)

1. ALIGNMENT (выравнивание) проводится

1. вручную
2. по разному в разных случаях
3. с использованием компьютерных программ.

2. Аберрационные мутации - это:

1. изменения затрагивающие значительный участок генома
2. точечные мутации.

3. В задачи молекулярной эпидемиологии входит

1. разработка аппаратной базы
2. разработка бактериологических методов анализа
3. разработка вирусологических методов анализа
4. разработка методов слежения за изменением первичной структуры генома возбудителя
5. разработка методов слежения за распространением возбудителя.

4. В природных и антропургических очагах России наиболее часто встречаются и стабильно циркулируют лептоспиры следующих видов:

1. Leptospira borgpetersenii
2. Leptospira interrogans
3. Leptospira kirschneri
4. Leptospira weilii
5. Leptospira wolffii.

5. В стационарах Москвы и Нижнего Новгорода наиболее часто встречающимся генотипом S. epidermidis был

1. ST189
2. ST2
3. ST59.

6. Возможности, предоставляемые основным сайтом MLST – PubMLST

1. автоматическая идентификации аллеля по последовательности
2. депонирование новых аллелей генотипов и изолятов
3. запрос на получение культур депонированных штаммов
4. программное обеспечение для анализа.

7. Генотип, ST (sequence type) - это

1. порядковый номер присваиваемый аллельному профилю штамма содержащему номера аллелей перечисленные в установленном порядке
2. совокупность все белков микроорганизма
3. совокупность всех генов микроорганизма.

8. Для дифференциальной диагностики микобактерий эффективно использовать

1. ПЦР и ПЦР в реальном времени
2. микроскопию
3. постановка биопробы.

9. Для определения аллеля в базе данных PubMLST нужно ввести

1. Аминокислотную последовательность
2. Номер (Accession) генома бактерии в базе данных GenBank
3. Последовательность фрагмента гена входящего в схему MLST.

10. Из каких стран в Поволжье мог быть завезен штамм L. borgpetersenii, вызвавший заболевание со смертельным исходом?

1. Австралия
2. Италия
3. Лаос
4. Тайланд.

11. К капиллярным секвенаторам относят

1. 3500 DNA analyzer
2. 3730xl DNA Analyzer
3. Ion Proton
4. NextSeq 550.

12. Какие генотипы (ST) Burkholderia cepacia complex выявлены у больных муковисцидозом в Дальневосточном Федеральном округе?

1. 241
2. 709
3. 728.

13. Какие дополнительные локусы, помимо MLST, были использованы для анализа штаммов Listeria monocytogenes?

1. Гены адгезинов
2. Гены аппарата третьей системы секреции
3. Гены интерналинов
4. Гены полиморфных мембранных белков.

14. Каким важным зонам в геноме C. psittaci сответствуют локусы расширенной схемы MLST, представленные на геномной карте?

1. белков наружной мембраны
2. генов антибиотикоустойчивости
3. генов интерналинов
4. полиморфных мембранных белков
5. рибосомальных РНК.

15. Какое специализированое программное обеспечение разработчики PubMSLT прпредлагают для MLST анализа полных геномов?

1. BLAST
2. Bacterial Isolate Genome Sequence Database (BIGSdb)
3. MIRU-VNTRplus.

16. Какой вид Achromobacter spp. преобладает в проанализированной выборке больных муковисцидозом?

1. Achromobacter dolens
2. Achromobacter pulmonis
3. Achromobacter ruhlandii.

17. Какой вид Burkholderia cepacia complex превалирует в проанализированной выборке российских больных муковисцидозом

1. Burkholderia cenocepacia
2. Burkholderia cepacia
3. Burkholderia multivorans.

18. Какой вид Chlamydia наиболее близок филогенетически Chlamydia psittaci?

1. Chlamydia abortus
2. Chlamydia pneumoniae
3. Chlamydia suis.

19. Какой генотип (ST) Burkholderia cenocepacia встречается чаще всего у российских больных муковисцидозом, инфицированных Burkholderia cepacia complex?

1. 208
2. 241
3. 709.

20. Какой генотип Chlamydia psittaci является наиболее распространенным среди возбудителей оринитозов?

1. ST24
2. ST35
3. ST47.

21. Какой генотип выявлен у штаммов Leptospira borgpetersenii, выделенных в России от грызунов?

1. 143
2. 146
3. 153.

22. Какой метод анализа с помощью капиллярных секвенаторов используют в MLVA?

1. секвенирование
2. фрагмент анализ
3. хроматография.

23. Какой метод используют для разделения синтезированных последовательностей ДНК?

1. ультрацентрифугирование
2. хроматографию
3. электрофорез в геле.

24. Какой подход предложил Сэнгер для расшифровки первичной структуры ДНК?

1. синтез белка
2. ферментативный синтез меченной комплементарной последовательности ДНК на изучаемой однонитчатой ДНК как на матрице
3. химический синтез ДНК.

25. Какую информацию можно получить, введя в окно «Enter query sequence» последовательность одного локуса MLST?

1. генотип
2. название локуса
3. номер аллеля.

26. Какую метку использовал Сэнгер для синтезируемой последовательности ДНК?

1. радиоактивный изотоп йода 131I
2. радиоактивный изотоп серы 32S
3. радиоактивный изотоп фосфора 32Р.

27. Кладограмма - это

1. филогенетическое дерево не содержащее информации о длинах ветвей
2. филогенетическое дерево содержащее информации о длинах ветвей.

28. Комплексное использование ПЦР и ОТ-ПЦР позволяет определить

1. биологичекие свойства микобактерий
2. состояние бактерии
3. эффективность лечения.

29. Маркерные мутации устойчивости к противотуберкулезным лекарственным препаратам выявляют с использованием

1. Гелевых ДНК-микрочипов
2. ИФА тест-систем
3. белкового сиквенса.

30. Метод обратной транскрипции с амплификацией (ОТ-ПЦР) выявляет

1. ДНК
2. аминокислоты
3. мРНК.

31. Молекулярные маркеры или биомаркеры это

1. простейшие организмы
2. уникальные клеточные органеллы
3. уникальные механизмы
4. уникальные последовательности нуклеотидов в ДНК РНК или аминокислот в белке.

32. Молекулярные методы получили развитие

1. В конце 20-го века
2. в 17 веке
3. в 19 веке.

33. Молчащая мутация

1. не изучена на генетическом уровне
2. не приводит к замене аминокислотной последовательности
3. приводит к замене аминокислотной последовательности.

34. Мультилокусные схемы типирования ДНК, данные которых подлежат цифровой обработке?

1. Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA)
2. Multi Locus Sequence Typing (MLST)
3. Multiple Locus Variable Number of Tandem Repeats Analysis (MLVA).

35. Название метода секвенирования, являющегося основополагающим при работе на капиллярных секвенаторах

1. метод Максама-Гилберта
2. метод Сэнгера
3. пиросеквенирование.

36. Операционная филогенетическая единица - это

1. фрагмент антитела
2. фрагмент генома или белка общий для всех сравниваемых организмов
3. фрагмент генома или белка различный для всех сравниваемых организмов
4. фрагмент клетки.

37. Основные характеристики эффективных схем молекулярного типирования:

1. возможность стандартизации
2. воспроизводимость в различных лабораториях
3. высокая дискриминирующая способность.

38. Первые схемы молекулярного типирования были основаны на амплификации и секвенировании

1. гена 16S рРНК
2. гена recA
3. гена rpoB.

39. Предпосылки возникновения молекулярной эпидемиологии

1. развитие генетических подходов
2. развитие клеточной биологии
3. развитие методов молекулярной биологии
4. развитие ферментативного анализа.

40. Принцип детекции нуклеотидов в капиллярных секвенаторах основан на

1. детекции красителей возбуждаемых излучением аргонового лазера
2. обнаружении ионов водорода которые выделяются во время полимеризации ДНК
3. хемилюминесценции.

41. Разработаны молекулярные методы, такие как

1. ПЦР и ПЦР в реальном времени
2. выделение вируса в культуре клеток
3. микрочипы
4. секвенирование.

42. Секвенирование нуклеиновых кислот (ДНК и РНК) - это

1. определение границ гена
2. определение первичной аминокислотной последовательности
3. определение первичной нуклеотидной последовательности.

43. Сколько лоусов аллельного профиля отличает ST146 от ST143 L. borgpetersenii?

1. 3
2. 4
3. 5.

44. Сколько филогенетических линий представляют Listeria monocytogenes, выделенные на территории России?

1. 1
2. 2
3. 5
4. 9.

45. Стандартная схема MLST схема включает

1. 500 локусов
2. 7 локусов
3. Геном целиком.

46. Существуют следующие типы изменчивости микробной популяции

1. внутриклональная и межклональная
2. точечная и аберрационная
3. ферментативные и не ферментативные.

47. Схемы MLST разработаны для:

1. бактерий
2. бактериофагов
3. грибов
4. только для грамм-положительных бактерий.

48. Уровень идентификации с помощью мультилокусных схем (MLST, MLVA)

1. вид
2. род
3. штамм.

49. Филогенетические исследования штаммов бактерий помогают:

1. определению титра антител
2. установлению иммунного статуса
3. установлению эволюционных связей между штаммами выделенными на различных территориях.

50. Филогенетический анализ - это

1. анализ родственных связей эволюционной истории между возбудителями
2. анализ топологических индексов
3. биохимический анализ.

51. Филограмма - это:

1. дендрограмма не содержащая информацию о длинах ветвей
2. дендрограмма содержащая информацию о длинах ветвей
3. фенограмма.

52. Химическую основу гибридизации между основаниями нуклеотидов составляют

1. водородные связи
2. ковалентные связи
3. межклеточное взаимодействие
4. связи в ионах металлов.

53. Хронограмма - это

1. дендрограмма содержащая информацию о длинах ветвей
2. филограмма длины ветвей в которой представляют эволюционное время.

54. Что изучает молекулярная эпидемиология?

1. биохимические механизмы
2. механизмы работы ферментов
3. микробиологические механизмы
4. молекулярные механизмы популяционных перестроек.

55. Что определяют молекулярные методы?

1. активность фермента
2. антитела к вирусу
3. иммунный ответ
4. патоген.