Тест НМО с ответами по теме «Секвенирование ДНК» Интерактивный образовательный модуль (ИОМ)

1. DdNTP – это

1. нуклеотиды обеспечивающие обрыв цепи
2. ионы для поддержания необходимой pH в реакции
3. фермент обеспечивающий синтез цепи
4. нуклеотиды обеспечивающие синтез цепи.

2. SNP-типирование – это анализ

1. титра иммуноглобулинов класса G
2. экспрессии белка
3. аффинности
4. однонуклеотидных полиморфизмов.

3. АТФ-сульфарилаза необходима для

1. обнаружения белка в реакции
2. комплементарного встраивания нуклеотида
3. биотинилирования праймера
4. получения АТФ из пирофосфата.

4. Аденин комплементарен

1. цитозину
2. гуанину
3. тимину
4. фосфатидилхолину.

5. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов – это

1. анализ последовательности мРНК
2. изучение первичной аминокислотной последовательности
3. способ исследования геномной ДНК путём ее разрезания с помощью эндонуклеаз рестрикции и дальнейший анализ фрагментов
4. изучение аффинности.

6. В развитии полигенных заболеваний полиморфизмы могут являться

1. фактором предрасположенности
2. определяющим механизмом клинической картины
3. ключевым фактором патогенеза
4. не имеющими значения факторами.

7. В состав ДНК входят

1. липополисахарид
2. азотистое основание
3. дезоксирибоза
4. остаток фосфорной кислоты.

8. Делеция участка ДНК – это

1. поворот нуклеотидной последовательности в геноме на 180 градусов
2. обмен между гомологичными хромосомами
3. потеря участка ДНК в геноме
4. вставка фрагмента ДНК в геном.

9. Длина фрагмента ДНК, который амплифицируется для реакции пиросеквенирования, составляет

1. 1000-1500нуклеотидов
2. 100-300нуклеотидов
3. 900-950нуклеотидов
4. 400-500нуклеотидов.

10. Инсерция участка ДНК

1. усиление активности промотора гена
2. робертсоновская транслокация
3. вставка фрагмента ДНК в геном
4. увеличение количества повторов в некодирующей части гена.

11. Капиллярный электрофорез используется в

1. NGS
2. вестерн-блоте
3. пиросеквенировании
4. секвенировании по Сэнгеру.

12. Люциферазо-опосредованная реакция заключается в

1. окислении люциферина в оксилюциферин
2. получении АТФ
3. обеспечении присоединения нуклеотида в растущую цепь
4. удалении побочных продуктов реакции.

13. Области применения секвенирования

1. секвенирование de novo
2. анализ титра иммуноглобулинов класса Е
3. SNP-типирование
4. определение активности ферментов
5. генетическая диагностика различных заболеваний.

14. Однонуклеотидный полиморфизм – это

1. различия в белковой последовательности
2. различия в длине генов у представителей одного вида
3. отличия в последовательности ДНК в несколько нуклеотидов в геноме представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом
4. отличия в последовательности ДНК в один нуклеотид в геноме представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом.

15. Пиросеквенирование – это метод секвенирования, основанный на

1. лигировании
2. обрыве цепи
3. детекции изменения pH при синтезе цепи ДНК
4. детекции высвобождающегося пирофосфата при элонгации цепи ДНК.

16. Полиморфизмы, не выраженные фенотипически, в лабораторной практике используют для

1. определения титра антител при инфекционных заболеваниях
2. уровня экспрессии TLR на поверхности клеток
3. идентификации личности
4. определения количества лимфоцитов.

17. Правило Чаргаффа гласит, что количество

1. адениловых оснований равно количеству тимидиловых
2. цитозиловых оснований равно количеству гуаниловых
3. адениловых оснований равно количеству гуаниловых
4. тимидиловых оснований равно количеству гуаниловых.

18. Праймеры, которые используются для пиросеквенирования

1. только обратный
2. прямой и обратный
3. прямой и обратный биотинилированный
4. только прямой.

19. Преимуществами секвенирования следующего поколения перед секвенированием по Сэнгеру являются

1. параллельное секвенирование образцов нескольких пациентов
2. предсказание структуры белка
3. большая точность
4. высокая производительность.

20. Преимуществом пиросеквенирования является

1. возможность прочтения протяженных участков генома
2. быстрая детекция однонуклеотидных полиморфизмов
3. использование для прочтения CpG-мотивов
4. параллельное секвенирование нескольких цепей ДНК.

21. При присоединении нуклеотида к цепи ДНК выделяется

1. АТФ
2. пирофосфат
3. ДНК-полимераза
4. фосфатаза.

22. Разновидности методик секвенирования следующего поколения

1. секвенирование путем обрыва цепи
2. секвенирование путем синтеза
3. пиросеквенирование
4. секвенирование путем лигирования.

23. Рестрикты – это

1. фрагменты ДНК полученные после обработки эндонуклеазами рестрикции
2. ферменты для получения библиотек ДНК
3. фрагменты мРНК
4. ферменты отщепляющие концевой нуклеотид.

24. Секвенирование de novo – это

1. ресеквенирование известных последовательностей
2. расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК
3. анализ профиля экспрессии генов
4. определение эпигенетической регуляции.

25. Секвенирование ДНК – это

1. определение специфичности взаимодействия антиген-антитело
2. прочтение последовательности ДНК
3. амплификация ДНК in vitro
4. определение последовательности мРНК.

26. Секвенирование по Сэнгеру позволяет прочитывать до

1. 600-700 нуклеотидов
2. 400-500 нуклеотидов
3. 500-600 нуклеотидов
4. 900-1000 нуклеотидов.

27. Секвенирование по Сэнгеру применятся для

1. идентификации мутаций
2. определения титра антител
3. валидации результатов секвенирования следующего поколения
4. определения состава субпопуляций лимфоцитов крови.

28. Субстратами для реакции пиросеквенирования являются

1. dNTP
2. люциферин
3. АДФ-5’-сульфарилаза
4. АТФ.

29. Эндонуклеазы рестрикции – это

1. антитела к ДНК-полимеразе
2. ферменты катализирующие присоединение нуклеотидов
3. гидролазы обеспечивающие гидролиз цепи ДНК в строго определенном месте
4. ферменты отщепляющие концевой нуклеотид с 3’-конца.

30. Этапы проведения пиросеквенирования

1. секвенирование путем синтеза
2. получение одноцепочечной ДНК
3. связывание эпитопа и паратопа
4. постановка ПЦР.